Самая страшная резня 1918 года, после Баку, была произведена армянами в городе Шемахе и селах Шемахинского уезда. Примечательно, что резню в Шемахе, а позже и в Кубе проводили вооруженные дашнакские отряды, посланные туда советской властью, непосредственно руководителями Бакинской Коммуны С.Шаумяном и Г.Коргановым. 

В письме В.Ленину 13 апреля 1918г. С.Шаумян сообщал об отправке в Шемаху «новых отрядов» с артиллерией и пулеметами. Этими отрядами руководил ближайший соратник С.Шаумяна, один из главных организаторов Бакинской резни С. Лалаян.

7 томов из 925 страниц следственных материалов (доклады, протоколы допросов потерпевших и свидетелей, сведения уездных и полицейских начальников, акты о понесенных убытках, количестве убитых и раненых и др.), собранных Чрезвычайной Следственной комиссией о Шемахинских событиях, являются еще одним доказательством зверств армян.

Целью вооруженного дашнакского отряда под руководством С.Лалаяна, посланного в Шемаху по указанию С.Шаумяна, было якобы очистить Шемахинский уезд от разбойничьих банд и, положив конец анархии в уезде, восстановить на этой территории безопасность. Отряд дает слово, что 15 марта, минуя Шемаху, отправится в село Медресе. Мусульмане, охраняющие на окраине города свои дома, увидев в тот день отряд, предположили, что готовится нападение, и открыли по нему огонь. В ответ и отряд стал стрелять. Вскоре перестрелка перекинулась на весь город. В результате обе стороны понесли потери. Однако представители трех проживающих в городе наций (азербайджанцы, армяне и русские) сумели собраться вместе и поклясться жить в мире, не нарушать закон и порядок.

Когда сообщили об этом соглашении руководителям отряда, посланного С.Шаумяном, они заявили, что «мусульманское духовенство может примириться с армянским духовенством, но народ армянский хочет войны с мусульманами и в этом деле их поддерживает Англия».

Азербайджанское население Шемахи, успокоенное принятым соглашением, наутро 18 марта разбужено было пушечными выстрелами. Нижнюю часть города, населенную азербайджанцами, из пушек и пулеметов обстреливали армяне и молокане. Через несколько часов после начала штурма армяне и молокане уже смогли войти в азербайджанскую часть города. Во время этого нападения они грабят дома азербайджанцев, громят и поджигают их и жестоко расправляются с гражданским населением. В сообщениях Чрезвычайной Следственной комиссии указывается, что в Шемахе армянами было убито несколько тысяч азербайджанцев. Среди убитых было немало уважаемых лиц, общественных деятелей, известных не только в Шемахе, но и во всем Азербайджане. Среди них депутат от Шемахи в I Государственной Думе Мамед Алиев, известный ахунд Гаджи Джафаргулу и др. Комиссия в сведениях своих сообщала, что «ущерб, нанесенный азербайджанскому населению города Шемахи, по средним подсчетам составил более 1 миллиарда рублей».

Вдохновленные лозунгом «Убив, ограбь и, ограбив, убей!» армяне в Шемахе и уезде, одержимые чувствами национальной вражды и национальной мести к азербайджанскому народу, наряду с расправой с мирным азербайджанским населением — женщинами, детьми, стариками, имели целью еще и нажиться за счет их имущества.

На основании доклада члена комиссии А.Новацкого о разрушении города Шемахи и случаях насилия над азербайджанским населением Чрезвычайная Следственная комиссия 12 июля 1919г. объявляет основными виновниками преступлений, совершенных в городе Шемахе, наряду с С.Лалаевым, выходца из Шемахи, проживающего в Баку Гаврила Караогланова, Аршака Гюльбендияна, Михаила Арзуманова, Арменака Мартиросяна и других (всего 31 человек). В постановлении отмечалось, что эти преступники, собрав вокруг себя несколько тысяч дашнаков, вооруженных пушками, пулеметами, ружьями, пистолетами и кинжалами, в течение нескольких дней убили несколько тысяч мирного азербайджанского населения, мужчин, женщин, детей. Убийства эти проведены были к тому же с особой жес­токостью. Армяне в Шемахе разграбили имущества более чем на 1 миллиард рублей, сожгли и уничтожили в городе все дома, принадлежавшие азербайджанцам. В городе было сожжено 13 мечетей, в том числе «Джума-мечеть», являвшаяся историческим памятником. Комиссия, возбудив уголовное дело против основных организаторов армянского вандализма, приняла постановление приступить к расследованию с привлечением их к уголовной ответственности.

В Шемахинском уезде армянами было разорено, сожжено и зверски убито население 86 азербайджанских сел. В актах о зверствах армянских вандалов, составленных Чрезвычайной Следственной комиссией по 53 селам в отдельности, указывается число убитых и нанесенный ущерб.

В соответствии с данными указанных актов в Шемахинском уезде армянами в 53 селах было убито 8 027 азербайджанцев, из них 4 190 мужчин, 2 560 человек — женщин и 1 277 человек — детей. На основании указанных актов ущерб, нанесенный армянами этим селам, составил 339, 5 миллионов рублей.

Из книги: Атахан Пашаев. Геноцид, депортации и территориальные претензии армян к азербайджанскому народу (XIX — XX вв.). На азерб. языке. – Баку, 2013, стр.39-42